非試點(diǎn)自開(kāi)票納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)差額征收營(yíng)業(yè)稅。

    《營(yíng)業(yè)稅暫行條例》第五條第一款規(guī)定，納稅人將承攬的運(yùn)輸業(yè)務(wù)分給其他單位或者個(gè)人的，以其取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用扣除其支付給其他單位或者個(gè)人的運(yùn)輸費(fèi)用后的余額為營(yíng)業(yè)額。非試點(diǎn)自開(kāi)票納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)，不論其他聯(lián)運(yùn)合作方是試點(diǎn)增值稅納稅人還是營(yíng)業(yè)稅納稅人、是試點(diǎn)一般納稅人還是小規(guī)模納稅人、是非試點(diǎn)自開(kāi)票納稅人還是代開(kāi)票納稅人，其支付給聯(lián)運(yùn)合作方的運(yùn)輸費(fèi)用都可以扣除。

    根據(jù)《中華人民共和國(guó)增值稅暫行條例》第八條（四）規(guī)定，接受貨物運(yùn)輸勞務(wù)的增值稅納稅人購(gòu)進(jìn)或者銷售貨物以及在生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)過(guò)程中支付運(yùn)輸費(fèi)用的，按照運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)上注明的運(yùn)輸費(fèi)用金額和7%的扣除率計(jì)算的進(jìn)項(xiàng)稅額可以抵扣。

    假設(shè)A企業(yè)是非試點(diǎn)自開(kāi)票納稅人，此聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)應(yīng)繳納交通運(yùn)輸業(yè)營(yíng)業(yè)稅：

    A企業(yè)應(yīng)繳納營(yíng)業(yè)稅（1110－555）×3%=16.65（萬(wàn)元）。

    甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅1110×7%=77.70（萬(wàn)元）。

    非試點(diǎn)代開(kāi)票納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)全額征收營(yíng)業(yè)稅

    《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于貨物運(yùn)輸業(yè)若干稅收問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2004]88號(hào)）第七條規(guī)定，代開(kāi)票納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)的，其計(jì)征營(yíng)業(yè)稅的營(yíng)業(yè)額為代開(kāi)的貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票注明營(yíng)業(yè)稅應(yīng)稅收入，不得減除支付給其他聯(lián)運(yùn)合作方的各種費(fèi)用。也就是非試點(diǎn)代開(kāi)票納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)全額征收營(yíng)業(yè)稅，不論其他聯(lián)運(yùn)合作方是什么類型的納稅人，不得減除支付給其他聯(lián)運(yùn)合作方的各種費(fèi)用。

    假設(shè)A企業(yè)是非試點(diǎn)代開(kāi)票納稅人，此聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)應(yīng)繳納交通運(yùn)輸業(yè)營(yíng)業(yè)稅：

    A企業(yè)應(yīng)繳納營(yíng)業(yè)稅1110×3%=33.30（萬(wàn)元）。

    甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅1110×7%= 77.70（萬(wàn)元）。

    試點(diǎn)一般納稅人接受試點(diǎn)一般納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)取得的增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額可抵扣?！对圏c(diǎn)實(shí)施辦法》第二十二條（一）規(guī)定，從銷售方或者提供方取得的增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅額準(zhǔn)予從銷項(xiàng)稅額中抵扣。

    假設(shè)A企業(yè)、B企業(yè)都是試點(diǎn)一般納稅人，都開(kāi)具了增值稅專用發(fā)票，此聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)應(yīng)繳納增值稅：

    A企業(yè)增值稅銷項(xiàng)稅額：1110÷（1＋11%）×11%=110（萬(wàn)元）。

    A企業(yè)可抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額：555÷（1＋11%）×11%=55（萬(wàn)元）。

    A企業(yè)應(yīng)納增值稅：110－55=55（萬(wàn)元）。

    甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅也就是A企業(yè)增值稅銷項(xiàng)稅額110萬(wàn)元。

    試點(diǎn)一般納稅人接受試點(diǎn)小規(guī)模納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)按取得的增值稅專用發(fā)票價(jià)稅合計(jì)金額7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。

    《交通運(yùn)輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務(wù)業(yè)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)有關(guān)事項(xiàng)的規(guī)定》第一條（四）規(guī)定，試點(diǎn)納稅人接受試點(diǎn)納稅人中的小規(guī)模納稅人提供的交通運(yùn)輸業(yè)服務(wù)，按照取得的增值稅專用發(fā)票上注明的價(jià)稅合計(jì)金額和7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。這是《中華人民共和國(guó)增值稅暫行條例》第八條（四）政策的延續(xù)。須要注意的是，已辦理稅務(wù)登記的小規(guī)模納稅人按《稅務(wù)機(jī)關(guān)代開(kāi)增值稅專用發(fā)票管理辦法（試行）》（國(guó)稅發(fā)[2004]153號(hào)）規(guī)定到稅務(wù)機(jī)關(guān)代開(kāi)增值稅專用發(fā)票，接受勞務(wù)方才能按上述規(guī)定計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額，接受試點(diǎn)小規(guī)模納稅人交通運(yùn)輸業(yè)服務(wù)開(kāi)具的普通發(fā)票不能抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

    假設(shè)A企業(yè)、B企業(yè)分別是試點(diǎn)一般納稅人和試點(diǎn)小規(guī)模納稅人，都開(kāi)具了增值稅專用發(fā)票。

    A企業(yè)可抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額：555×7%= 38.85（萬(wàn)元）。

    A企業(yè)應(yīng)納增值稅：110－38.85=71.15（萬(wàn)元）。

    甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅110萬(wàn)元。

    試點(diǎn)一般納稅人接受非試點(diǎn)營(yíng)業(yè)稅納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)銷售額差額計(jì)算

    附件2：《交通運(yùn)輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務(wù)業(yè)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)有關(guān)事項(xiàng)的規(guī)定》第一條（三）1第一款規(guī)定，試點(diǎn)納稅人提供應(yīng)稅服務(wù)的銷售額，按照國(guó)家有關(guān)營(yíng)業(yè)稅政策規(guī)定差額征收營(yíng)業(yè)稅的，允許其以取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用扣除支付給非試點(diǎn)納稅人（指試點(diǎn)地區(qū)不按照《試點(diǎn)實(shí)施辦法》繳納增值稅的納稅人和非試點(diǎn)地區(qū)的納稅人）價(jià)款后的余額為銷售額。

    假設(shè)A企業(yè)、B企業(yè)分別是試點(diǎn)一般納稅人和非試點(diǎn)營(yíng)業(yè)稅納稅人。

    A企業(yè)銷售額：（1110-555）÷（1＋11%）=500（萬(wàn)元）。

    A企業(yè)應(yīng)交增值稅：500×11%=55（萬(wàn)元）。

    甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅應(yīng)該是A企業(yè)開(kāi)具的增值稅專用發(fā)票所注明的銷項(xiàng)稅額1110÷（1＋11%）×11%=110（萬(wàn)元）。

    試點(diǎn)小規(guī)模納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)增值稅銷售額差額計(jì)算

    根據(jù)附件2：《交通運(yùn)輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務(wù)業(yè)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)有關(guān)事項(xiàng)的規(guī)定》第一條（三）1第二款規(guī)定，試點(diǎn)納稅人中的小規(guī)模納稅人提供交通運(yùn)輸業(yè)服務(wù)和國(guó)際貨物運(yùn)輸代理服務(wù)，按照國(guó)家有關(guān)營(yíng)業(yè)稅政策規(guī)定差額征收營(yíng)業(yè)稅的，其支付給試點(diǎn)納稅人的價(jià)款，也允許從其取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用中扣除；以及上述第一條（三）1第一款規(guī)定，試點(diǎn)小規(guī)模納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)無(wú)論聯(lián)運(yùn)合作方的納稅人類型，都可以差額計(jì)算銷售額。和營(yíng)業(yè)稅規(guī)定不同，根據(jù)國(guó)稅發(fā)[2003]121號(hào)及相關(guān)文件規(guī)定，非試點(diǎn)貨物運(yùn)輸業(yè)納稅人分為自開(kāi)票納稅人和代開(kāi)票納稅人；而代開(kāi)票納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)取得的收入不得減除支付給其他聯(lián)運(yùn)合作方的各種費(fèi)用，而試點(diǎn)小規(guī)模納稅人從事聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)，可以差額計(jì)算銷售額并繳納增值稅。

    假設(shè)A企業(yè)是小規(guī)模納稅人。

    A企業(yè)銷售額：（1110-555）÷（1＋3%）=538.84（萬(wàn)元）。

    A企業(yè)應(yīng)交增值稅：538.84×3%=16.17（萬(wàn)元）。

    小規(guī)模納稅人提供應(yīng)稅服務(wù)，接受方索取增值稅專用發(fā)票的，可以向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)代開(kāi)。A企業(yè)可以為甲公司出具增值稅專用發(fā)票。另外，試點(diǎn)納稅人接受試點(diǎn)納稅人中的小規(guī)模納稅人提供的交通運(yùn)輸業(yè)服務(wù)，按照取得的增值稅專用發(fā)票上注明的價(jià)稅合計(jì)金額和7%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。甲公司可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅應(yīng)該是1110×7%=77.70（萬(wàn)元）。

    以上分析可知，稅改試點(diǎn)后，納稅人聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)應(yīng)區(qū)分聯(lián)運(yùn)合作各方不同的納稅人類型分別進(jìn)行稅務(wù)處理。